پس از واگذاری رهبری عملیات ویژه و شبانه به نیروهای امنیتی افغانستان، قوماندانان اردوی ملی با 16 مورد از طرح های عملیاتی نظامیان آمریکایی مخالفت کردند . شیر محمد کریمی، رئیس ستاد اردو در گفت وگو با رسانه ها اعلام کرد در 2 ماه گذشته، 14 تا 16 طرح عملیات شبانه که توسط نظامیان خارجی تهیه شده بود، توسط قوماندانان اردو افغانستان رد شده است. وی گفت: اردوی ملی برای حفظ جان غیرنظامیان با این طرح ها مخالفت کرده است. تلویزیون افغانستان نیز روز شنبه گزارش داد قوماندانان نظامی آمریکا اعلام کردند که این 16 طرح ، شامل اطلاعات در خصوص فرماندهان ارشد مخالفان مسلح دولت افغانستان بوده است. بر اساس توافق اخیر میان مقامات دولتی و ناتو، رهبری عملیات ویژه و شبانه به نیروهای افغان واگذار شد. قوماندانان اردوی ملی در حالی با طرح های عملیاتی نظامیان خارجی مخالفت کرده اند که هفته گذشته، حدود 20 غیرنظامی افغان توسط نیروهای ناتو کشته و دهها تن دیگر زخمی شدند. این موضوع باعث شد که حامد کرزی، رئیس جمهور قوماندان نظامیان خارجی و سفیر آمریکا در کابل را به قصر ریاست جمهوری احضار کند.