اظهارات لئون پنتا رئیس سازمان جاسوسی امریکا مبنی بر قابل اعتمادنبودن ارتش و نیروهای امنیتی پاکستان در عملیات علیه اسامه بن لادن، به تنش های دو کشور دامن زده است. مقامات امریکایی می گویند پاکستان از عملیات کشته شدن سرکرده القاعده در شمال شرق پاکستان بی اطلاع بوده است. پنتا نیز گفته است امریکا مقامات پاکستانی را به این دلیل از عملیات یادشده مطلع نکرده که احتمال دخالت آن ها در این حمله وجود داشته است. این در حالی است که سلمان بشیر وزیر امور خارجه پاکستان، چهارشنبه (14 ثور) اظهارات رئیس سازمان سیا را ناراحت کننده دانسته است. وی در واکنش به این اظهارات گفت: "نیروهای امنیتی ما مدت ها قبل، محل را شناسایی کرده و سازمان های امنیتی امریکا را در جریان یافته­های خود قرار داده بودند." وی افزود: "البته آن ها تجهیزات بسیار پیچیده تری برای بررسی و کشف جزئیات در اختیار دارند." باراک اوباما، رئیس جمهور امریکا، شام­گاه یکشنبه (11 ثور) به وقت امریکا خبر کشته شدن بن لادن را در خانه ای نزدیک اسلام آباد پایتخت پاکستان تایید کرد. در این میان گزارش های ضدونقیضی از سوی کاخ سفید درباه این عملیات منتشر شده است. یکی از این گزارش ها این است که بن لادن در زمان حمله مسلح نبوده ولی در برابر نیروهای امریکایی مقاومت کرده است. هم زمان با افزایش بحث درباره این که مقامات پاکستانی تا چه حد از اجرای عملیات علیه بن لادن آگاهی یافته­اند. درباره این­که چگونه دو بالگرد نظامی امریکایی بدون داشتن مجوز از سوی ارتش و سرویس اطلاعات و امنیت پاکستان در نزدیکی اسلام آباد فرود آمده اند، نیز تردیدهایی وجود دارد. کارشناسان بر این باورند که سناریو این عملیات با هماهنگی سازمان جاسوسی امریکا (سیا) و سازمان اطلاعات ارتش پاکستان موسوم به آی اس آی نوشته شده و در این عملیات بن لادن کشته نشده است. پیش از این نیز بی نظیر بوتو به دنبال سوءقصد نافرجام به جانش در اکتبر 2007 میلادی طی یک مصاحبه اعلام کرده بود بن لادن سال ها پیش کشته شده است. افزون بر این، تعدادی از اعضای نیروهای مسلح امریکا و فرماندهان نظامی این کشور نیز گفته اند که بن لادن در جریان یک بمباران گسترده طی سال های اولیه حمله تحت امر امریکا به افغانستان جان باخته است.