ریاست اطلاعات و فرهنگ طالبان می‌گویند که آرامگاه  حکیم ناصر خسرو را به صورت اساسی و با در نظرداشت قدامت تاریخی آن مرمت‌کاری می‌کنند.

شماری از ساکنان بدخشان به هشت صبح می‌گویند که افراد طالبان در دوران حکومت پیشین شماری از آرامگاه‌ها و آبدات تاریخی به شمول آرامگاه ناصر خسرو در این ولایت را تخریب کرده‌ بودند.

یک باشنده ولسوالی یمگان بدخشان گفت: «در گذشته بخش‌هایی از آرامگاه حکیم ناصر خسرو توسط افراد طالبان تخریب گردیده بود.

آن‌ها می‌خواستند این بنای تاریخی را به آتش بکشانند، ولی متوجه شدند که در سقف آرامگاه خط‌هایی از آیات قرآن نوشته شده است و همین باعث شد که آرامگاه را به آتش نکشند.

به گفتی وی اما طالبان بخش‌هایی از آن را ویران کردند. وی افزود که پس از آن، افراد دیگر که قاچاق‌بران آثار تاریخی بودند، بارها به کاوش در قسمت‌هایی از این بنای تاریخی دست زدند و قسمت‌هایی از قبر ناصر خسر‌و و دو قبری که در کنار آن بود را تخریب کردند.